BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB035C01LP1|AL430013
(977 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig951 1883 0.0
3x_Contig1324 1214 0.0
3x_Contig1694 224 2e-58
>3x_Contig951
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Identities = 970/978 (99%), Gaps = 1/978 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatcaatagcaaacatgcggtaacgacacaggtccatgcgatagtagcacacacggcagc 60
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Query: 421 ggtcaaagcaccgcaagcagcagccaagtttgttgaataggcagagtaccaagctctaat 480
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Sbjct: 1943 ggtagcgttaccagcggaacccgggttgaaaccaccaatccaaccgatccaagtgaagac 1884
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Query: 781 gaccatcattgggaacaatctagctctttcacaggca-caccgaccatcaaaataccggt 839
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Query: 900 agaaggagcaccaagaacgtttttgaaaccaaattyggataaagtaccgatgaaaccgtt 959
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Query: 960 acctcttgtattatggga 977
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Sbjct: 1463 acctcttgtattatggga 1446
>3x_Contig1324
Length = 5803
Score = 1214 bits (611), Expect = 0.0
Identities = 879/969 (90%), Gaps = 1/969 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatcaatagcaaacatgcggtaacgacacaggtccatgcgatagtagcacacacggcagc 60
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Sbjct: 5502 gatcaatagcaaacatgcggtaacgacacaggtccaggcgacactcgcacacatggcagc 5443
Query: 61 gaattgataaccaacttgcttgtagttgtggttgatccaacctccagcaattggggaact 120
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Sbjct: 5442 taattggtaaccaacttgcttgtagttatggttgatccaacctccagcaattggggaact 5383
Query: 121 ttcaacgccggccaatgcgttaatgtaatcggcagcgaaaataccagtcaaaactgaacc 180
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Sbjct: 5382 ttcaacgccggccaatgcgttaatgtaatcggcagcgaaaataccagtcaaaactgaacc 5323
Query: 181 gatacagccaccgacaccatgcaaagcgtacacgtccaaaccgtcatcgatcttcaacaa 240
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Sbjct: 5322 gatacagccaccgacaccatgtaaagcgtacacgtccaaaccgtcatcgattctcaagat 5263
Query: 241 attcttcaggtcgacagccaagttacaaccagcagctgtgacgataccgatgataacgga 300
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Sbjct: 5262 atgcttcaaatcaacggcgaaattacaaccagcagcggtaacaataccaacgataactga 5203
Query: 301 agcccataatggaacgaaaccagcggcaggggtaataccgaccaaaccggaaatggcacc 360
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Sbjct: 5202 ggcccataatggaacaaatccagcagccggagtaataccaactaaacctgcaatcgcacc 5143
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Sbjct: 5142 ggagcacaaaccaacagtagtccatttacgaccacatctaaagtaatcgatgaacatcca 5083
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Sbjct: 5022 ggtagtgttaccggcggagcctgggttgaaggcaccaatccaacctagccaagtgaagac 4963
Query: 541 agttcccaacacgacagaggtaacggaatgtggcttgtacttaggaacaccagacttcgt 600
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Query: 601 caatggatcatttcttctacccaaaatcaaagcgtaaatcaaagcaccgtgaccggagca 660
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Sbjct: 4902 caatggatcgtttctcttacccaaaatcaaagcgtacatcaaagcaccatgaccggagca 4843
Query: 661 aatgtggactggaccaccacctgcgtgatctaaagcaccaagggtagccaaccaaccctc 720
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Sbjct: 4842 aatgtggactggaccaccacctgcgtaatctaaagcaccaagggcagccaaccaaccctc 4783
Query: 721 tgggttccaagtmcaacaagcaattggacagtatacgatggtgatgaacaagaacaaaaa 780
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Query: 960 acctcttgt 968
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Sbjct: 4542 acctcttgt 4534
>3x_Contig1694
Length = 18020
Score = 224 bits (113), Expect = 2e-58
Identities = 116/117 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatcaatagcaaacatgcggtaacgacacaggtccatgcgatagtagcacacacggcagc 60
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Sbjct: 11134 gatcaatagcaaacatgcggtaacgacacaggtccatgcgatagtagcacacacggcagc 11075
Query: 61 gaattgataaccaacttgcttgtagttgtggttgatccaacctccagcaattgggga 117
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Sbjct: 11074 taattgataaccaacttgcttgtagttgtggttgatccaacctccagcaattgggga 11018
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 5678
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 5678
Number of successful extensions: 50
Number of sequences better than 1.0e-20: 3
length of query: 977
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 961
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 9926783079
effective search space used: 9926783079
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.8 bits)